巴蜀中学自2010年推行高中课程改革以来，坚持“积极、务实、有序”的实施策略，成立了重庆市首个校级课程改革指导处（简称课改处）；积极开展“131校本课程体系建设”（见2013年3月《课程 教材 教法》7000余字报道），努力探索“三全一自主”的研究性学习实施模式（见2012年12月《综合实践活动》）。随着课程改革的深入推进，学校将改革引入“雷区”——大胆尝试国家必修课程校本化，通过走班制、小班化，让学生自主选择学习内容、自主选择任课教师，增强了学生学习的主动性，有利于学生个性特长彰显。

2014-2015学年度，学校在鲁能校区高2017级就音乐、信息技术学科开展首轮尝试。

音乐课程4个选修模块，即舞蹈（他们和她们：我的第一次舞会）、口琴、演唱教学艺术、小提琴；信息技术3个选修模块，即编程之美、网络应用、scratch应用。